В письме от 13 сентября 2018 г. N 03-07-11/65627 Минфин России разъяснил, что запрет на принятие к вычету сумм НДС по продукции, не предусмотрен.
Если компания получила субсидии для возмещения недополученных доходов в связи с производством и (или) реализацией товаров (работ, услуг), облагаемых НДС, то суммы таких субсидий подлежат включению в налоговую базу по НДС (п. 1 ст. 162 НК РФ).
Исключение – получение субсидий в связи с применением государственных регулируемых цен или реализацией товаров (работ, услуг) с учетом льгот. Данные субсидии в налоговую базу по НДС не включается. Пример. Субсидии на возмещение недополученных доходов.
Транспортная компания, получила из бюджета субсидию на возмещение части недополученных доходов в связи с перевозкой по регулярным маршрутам (с посадкой и высадкой только в установленных остановочных пунктах) льготных категорий пассажиров (пенсионеров, студентов, детей-сирот и др.).
Общая выручка от перевозки всех пассажиров составила 380 000 рублей, в том числе от льготников – 80 000 рублей. Из бюджета получена субсидия 80 000 руб. В бухгалтерском учете надо сделать такие записи: ДЕБЕТ 50 «Касса» КРЕДИТ 90 «Продажи», субсчет 1 «Выручка» – 300 000 руб. – отражена выручка от пассажиров-не льготников; ДЕБЕТ 76 «Расчеты с разными дебиторами и кредиторами», субсчет «Расчеты с министерством транспорта» КРЕДИТ 90 «Продажи», субсчет 1 «Выручка» – 80 000 руб. – отражена выручка от пассажиров-не льготников; На день получения субсидии ДЕБЕТ 51 «Расчетные счета» КРЕДИТ 76, субсчет «Расчеты с министерством транспорта» – 80 000 руб. –получена из бюджета субсидия.
Источник: http://www.buhgalteria.ru/news/n167388